在试管婴儿的临床结果观察中，医生意外地发现冷冻胚胎移植周期的异位妊娠率比刺激取卵周期的卵原细胞和囊胚阶段的胚胎都要低，这是有道理的，原因是冷冻胚胎移植周期的子宫内膜更接近生理状态，胚胎会很乐意植入，不会意外地进入输卵管。
宫外孕被称为异位妊娠，其中95%是输卵管妊娠，而较少见的是卵巢妊娠、腹腔妊娠、阔韧带妊娠和宫颈妊娠，这取决于植入的部位。典型的临床表现是停经后腹痛和阴道出血。
宫外孕的发生率在自然妊娠中约为1%，在IVF周期中为2.1%至8.6%，约为自然妊娠的两倍。在自然受孕条件下，宫内和宫外同时怀孕的情况很少发生，约为4,000至10,000次怀孕中的1次，但在促排卵或体外受精（IVF）治疗中的发生率要高得多，约为0.86%（20/2322）。
试管婴儿中宫外孕高发的原因
试管婴儿技术导致宫外孕风险增加的确切原因仍不清楚，可能包括。
[1]既往宫外孕史：缺失一侧输卵管和对侧输卵管功能障碍往往是试管婴儿治疗的原因。
[2] 显著的输卵管病变：盆腔感染、输卵管炎症和周围粘连、子宫内膜异位症以及其他因素可能导致输卵管结构和/或功能的改变。
[3] 以前有输卵管手术史：输卵管的整形手术、造口术和粘连分离术都会影响输卵管的功能。
[4] 受影响的输卵管蠕动。促排卵引起的体内高雌激素、高孕激素的高内分泌环境，影响了输卵管运送胚胎的蠕动功能。
[5] 改变胚胎的植入潜力：通过体外操作改变胚胎的植入能力在理论上是可能的。滋养细胞的发育潜力可能受到不同的体外培养条件和植入条件的错误识别的影响。
[6]子宫内膜接受能力差或与胚胎不同步，胚胎拒绝在子宫内膜腔内植入等。
试管婴儿中宫外孕的概率
一项研究发现，试管婴儿冷冻胚胎移植周期的异位妊娠发生率明显低于新鲜移植周期，冷冻胚胎周期第3天卵裂期冷冻胚胎移植的异位妊娠率为1.17%，第5天囊胚期移植为2.63%，新鲜周期为3.67%。
在各种胚胎解冻移植周期中，自然周期的异位妊娠发生率最低，为0.64%；激素替代周期为1.9%；微排卵周期为0.95%。大多数作者认为，激素刺激对子宫内膜耐受性的影响将增加异位妊娠的发生率。